La reacción que se desencadenó por la promulgación de la Constitución,
la oposición manifiesta de la Iglesia católica, las divisiones internas del
partido liberal, así como las indecisiones y titubeos del ejecutivo terminaron
por abrir las puertas del conflicto armado. Comonfort, al adoptar el Plan de
Tacubaya contra la Constitución, proclamado el 17 de diciembre de 1857 por el
general Félix Zuloaga, estaba destruyendo las bases de su propio poder.
A fines de diciembre, el comandante de la ciudad de San Luis Potosí,
Mariano Morett, se adhirió al Plan de Tacubaya y desconoció a las autoridades
que no lo aceptaran. Los empleados del gobierno huyeron, la tropa abandonó sus
puestos, los diputados también se fueron y Degollado salió hacia Venado donde
estableció el gobierno del estado.
Comonfort intentó corregir su desatino mediante la restitución del
partido liberal en el poder; liberó a Benito Juárez, presidente de la Suprema
Corte de Justicia, apresado al proclamarse el Plan de Tacubaya, y se exilió. De
acuerdo con la Constitución, correspondía a Juárez ocupar la presidencia que,
dadas las circunstancias, se estableció en Guanajuato.
El coronel José María Alfaro, jefe militar de la guarnición de San Luis,
fue designado jefe del movimiento conservador. Proclamó las bases orgánicas de
1843 y asumió el mando político y militar del estado.
Félix Zuloaga fue nombrado presidente interino e inició su régimen con
la derogación de las leyes sobre desamortización y obvenciones parroquiales.
Los fueros militar y eclesiástico fueron restablecidos.
El coronel Alfaro fortificó San Luis Potosí y recibió apoyo de militares
conservadores de Armadillo, Rioverde y Matehuala —entre ellos, Valentín Cruz y
Tomás O'Horán—. Los militares liberales operaban en el norte del estado gracias
al apoyo de las fuerzas de Vidaurri. El primer encuentro entre ambos bandos se
dio en la hacienda de Solís, propiedad del español Joaquín Hernández Soto; los
liberales al mando del general Mariano Escobedo triunfaron sobre los
conservadores que capitaneaba el general Cruz.
Los generales Luis G. Osollo y Miguel Miramón se encargaron de la
campaña del norte cuando Benito Juárez se retiró a Guadalajara. Doblado
capituló en Guanajuato y entregó la ciudad al general Osollo. En marzo, Parrodi
capituló en Guadalajara y la entregó a Miramón. Éste avanzó hacia el norte con
el objetivo de enfrentar, cautelosamente, a las fuerzas de Vidaurri y tomó
Zacatecas de manera pacífica.
Mientras que los conservadores habían sido derrotados, pero no habían
desaparecido y el gobierno de Juárez tuvo que responder a las presiones de
estas facciones. Una de estas concesiones fue la amnistía a los guerrilleros
conservadores capturados que seguían resistiendo el gobierno de Juárez, a pesar
de que estos mismos guerrilleros capturados ejecutaron a los prisioneros
liberales, que incluía a Melchor Ocampo. Benito Juárez también enfrento
presiones externas de los países como Gran Bretaña, España y Francia por las
grandes deudas que se les adeuda por parte de México. Las facciones
conservadoras en México, que aún querían una monarquía al estilo europeo para
México, eventualmente conspiraron con las fuerzas francesas para instaurar el Segundo Imperio Mexicano durante la Intervención Francesa en México.
